Modesta città all'ombra di Cartagine, Kairouan e poi Mahdia, Tunisi fu infine designata capitale della Tunisia nel 1159. In seguito ha dato il nome all'intero Paese. La città è costruita su diverse colline che degradano dolcemente verso il lago di Tunisi. Nel 1270, Luigi IX (Saint-Louis) morì sui bastioni di Tunisi durante l'Ottava Crociata.
Fino al XVI secolo, la città fu regolarmente saccheggiata, successivamente dagli Ottomani (in particolare dal pirata Barbarossa) e dagli Spagnoli (in particolare da Carlo V). Nel 1574, gli Ottomani conquistarono definitivamente la città. Il protettorato francese fu istituito nel 1881 fino all'indipendenza nel 1956. La capitale ha ospitato la sede della Lega Araba dal 1979 al 1990, prima di cederla al Cairo, in Egitto. Contemporaneamente, Yasser Arafat vi andò in esilio, stabilendovi la sede dell'OLP dal 1982 al 1994 e il suo ritorno in territorio palestinese.